Uus Akropoli muuseum on jagatud kolmeks põhiosaks: alumine, keskmine ja ülemine. Hoone välisküljeks on päikesekaitse omadustega klaaspakette sisaldav VARIO klaassein. Teine, sisemine kiht on valminud lamineeritud isikuturvaklaasist STADIP. Päikesekaitse omadustega klaaspaketid hoiavad sisemise fassaadi temperatuuri umbes 23 °C juures isegi siis, kui väljas on üle 40 °C sooja. Muuseumi alumine, arheoloogiliste väljakaevamiste kohal asetsev osa toetub piilaritele. See ekspertidega kooskõlastatud hoolikalt paigaldatud sambavõrgustik on mõeldud paiga kaitseks. Samal tasandil asub sissepääs koos fuajeega, ajutiste näituste alad, auditoorium ja abiruumid. Arheoloogiliste väljakaevamiste kohal paiknev klaasist kaldtee viib keskosa galeriideni, mis on toetatud pikkadele sammastele ja asuvad kaks korda kõrgemas ruumis. Kogu muuseumis, kuid eelkõige alumistel tasanditel asuvate kaevenäituste klaaspõrandate valmistamisel on kasutatud klaasi LITE-FLOOR. Ülemine osa hõlmab läbipaistvat ruumi, kus on ideaalne valgus akropolis leiduvate skulptuuride vaatlemiseks. Selle valmistamisel on kasutatud musta emailkattega klaasi EMALIT ja kõige moodsamat klaasitehnoloogiat, et kaitsta galeriid liigse soojuse ja valguse eest. Peale marmori ja betooni domineerib kogu muuseumis selgelt klaas. Sellega on kaetud kõigist nähtavatest sise- ja välispindadest enam kui 80%.
